李涛 , 徐小万 , 李颖 , 李明珠 , 王恒明 , 徐晓美 , 罗少波

广东省农科院蔬菜研究所, 广州, 510640
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2014 年, 第 12卷, 第 14 篇   doi: 10.13271/j.mpb.012.000306
收稿日期: 2013年10月25日    接受日期: 2013年12月11日    发表日期: 2014年01月15日

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本研究调查了一年生辣椒和中华辣椒种的DNA甲基化多样性。选取了24个一年生辣椒栽培种和6个中华辣椒栽培种作为研究对象，采用MSAP (methylation-sensitive amplification polymorphism)技术对其基因组CCGG位点的甲基化多样性进行了分析。结果表明，从63对MSAP引物中筛选出5对重复性好、条带清晰的引物对，对30份辣椒种质基因组 DNA进行MSAP扩增，得到939条带谱，其中多态性条带937个，多态性比例高达99.79%。DNA甲基化模式分析表明，类型玉为非甲基化带型(3721)，类型域为半甲基化带型(3152)，类型芋为全甲基化带型(3839)，辣椒甲基化模式主要以全甲基化为主，一年生辣椒(Capsicum annuum L.)和中华辣椒(Capsicum chinense Jacquin)甲基化条带平均分别为319和 217，其扩增位点的甲基化率分别77.24%和63.64%，差异达极显著水平。基于相似性系数的UPGMA法聚类分析，在 0.68相似水平可以将30个种质分为3个类，第1类：No.10~No.13和No.15共5个种质，其中No.10 为一年生辣椒，其它 4个为中华辣椒；第2类：No.2~No.9、No.14、No.16~No.30，其中No.14和No.17为中华辣椒；第3类：只有No.1，为一年生辣椒。应用MSAP未能将一年生辣椒和中华辣椒区分开来，表明辣椒表观遗传十分丰富。Nei's基因多态性指数(h)和Shannon信息指数(I)在2个栽培种中分别为0.204 0和0.329 8、0.186 4和 0.297 5，一年生辣椒的表观遗传多样性稍高于中华辣椒。DNA甲基化多样性作为标志遗传多样性的一种信号源，本研究结果为深入探讨辣椒种群分化及物种进化奠定了基础。

辣椒；表观遗传多样性；DNA甲基化；MSAP